Thành phố Cuồng loạn

Giới thiệu cơ bản về dự án và ngôn ngữ lập trình chính ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin với high-throughput sequencing) là một phương pháp để xác định khả năng truy cập của chromatin trên toàn bộ genoma. Phương pháp này sử dụng Tn5 transposase siêu hoạt động để chèn bộ điều chỉnh đọc vào các vùng chromatin mở. Sau đó, thông ...

Giới thiệu Tài liệu này cung cấp cái nhìn tổng quan về phân tích dữ liệu ATAC-seq sử dụng các gói công cụ trong môi trường Bioconductor. Nội dung được chia thành nhiều phần, bao gồm toàn bộ quy trình xử lý từ đầu đến cuối như căn chỉnh reads, kiểm soát chất lượng (QC), gọi đỉnh (peak calling), phân tích giàu gen, tìm kiếm motif và phát hiện vùn ...