Phân tích biểu hiện gen khác biệt với DESeq2: Hiểu sâu về các bước thống kê

Mục tiêu học tập Nắm rõ từng giai đoạn trong quy trình xử lý của DESeq2 Xác định nguồn biến thiên và kiểm tra hệ số chuẩn hóa (size factors) Đánh giá độ phân tán gen và vai trò của nó trong mô hình Hiểu tại sao độ phân tán là yếu tố then chốt trong phân tích biểu hiện khác biệt Quy trình xử lý của DESeq2 Khi tạo đối tượng DESeqDataSe ...

Đăng vào ngày 8 tháng 7 lúc 05:56

Hướng dẫn chuẩn hóa count trong RNA-seq với DESeq2

Chuẩn hóa dữ liệu đếm (count normalization) là bước thiết yếu trước khi tiến hành phân tích biểu hiện gen khác biệt (differential expression analysis). Mục tiêu là loại bỏ ảnh hưởng của các yếu tố không liên quan đến sinh học, giúp so sánh mức biểu hiện giữa các mẫu một cách chính xác. 1. Các yếu tố cần chuẩn hóa 1.1. Độ sâu giải trình tự (se ...

Đăng vào ngày 27 tháng 5 lúc 05:48